天昊生物微生物多样性测序云平台全面升级!

上海天昊生物

为了进一步满足广大客户的需求，让微生物多样性分析内容更加多元化，经过多轮调试，天昊生物微生物多样性测序分析云平台GS-Online全面升级!

升级后的GS-Online云平台具有以下优势：

功能强大：常规相对定量扩增子测序和16S扩增子绝对定量测序均支持线上分析；
操作简单：操作界面极其简单，快速得到完整报告，一键即可下载；
自主性强：根据您的科研需求，自由分组，自由删减OTU或物种；

接下来让我们一起看看升级后的GS-Online云平台如何使用吧。

数据准备

拿到项目分析结果后，云平台分析所需数据均在Total_OTU目录下，打开Total_OTU目录：（1）绝对定量测序项目目录下有OTU文件、单位DNA/样本的OTU文件、分组文件、环境因子数据和功能预测数据；（2）相对定量测序项目目录下有OTU文件、分组文件、环境因子数据和功能预测数据。

》绝对定量文件结构

》相对定量文件结构

云平台使用

》登录云平台

打开天昊生物官网，点击技术支持，点击云平台即可登录，或输入：http://cloud.geneskybiotech.com/login.html 登录，输入用户名和密码登录。账号申请请联系销售经理。

》新建分析

登录后，点击新建项目，输入项目名称，点击项目名称，新建分析。

》提交数据

绝对定量数据提交

输入分析名后，依次导入所需数据，点击运行；

其中功能预测的数据，如仅分析COG，则只提交COG的文件就可以。

相对定量数据提交

》数据结果查看

点击分析名称，可以看到分析进展。如果没有报错信息，一般30分钟~4小时分析完成。

》结果展示

点击项目名称，点击新建的分析后，弹出如下链接，单击链接即可下载结果。

链接打开后，如下图所示，可以查看结题报告。右上角有下载链接。分析结果请及时下载至本地电脑。

文件格式

》OTU文件

打开OTU数据，如下图所示：A列是OTUid名称，中间是样品中OTU丰度，后面是OTUid的注释。

》分组文件

打开分组文件，如下图所示：文件需要有表头，A列是样品名，后面是不同的分组信息。以B列为例，36个样品分为4组一起分析，最终的结果在ABCD目录下存放。

》功能预测文件

功能预测的文件，COG文件需要以COG_id:description为表头。KEGG文件需要以KEGG_id:description为表头。如下所示：

》环境因子数据

环境因子数据A列是样品名称，后面是环境因子的数据。名称不能有中文、空格。环境因子数据中若有空单元格，则这一行样品的数据剔除不分析。

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