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微量mRNA测序

微量mRNA测序

技术简介:

微量mRNA扩增转录组测序利用SMART-seq2技术进行mRNA的高效、无偏好扩增和高通量测序,尤其适用于无法进行常规mRNA测序的微量样本。通过对特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的全部mRNA进行测序,在全面快速得到基因表达谱变化的同时,还可以根据序列信息精确地分析转录本的可变剪切及基因融合现象。


技术参数及分析内容


技术优势


   • 开放的全转录组分析:无需预先设计探针,直接对任何物种进行最全面的转录组分析;
   • 准确性高:数字化信号,直接测定每个转录本片段的序列;
   • 检测阈值宽:跨越6个数量级的宽检测阈值,能同时鉴定及定量正常和稀有的转录本;
   • 分辨率高:可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异;
   • 起始量极低:total RNA总量仅需> 400pg,适用于珍贵样本的测序。
   • 高效可靠的扩增技术:灵敏度高、无偏好的扩增技术可以富集全长转录本,并且保持原始转录本的相对丰度。

技术参数及分析内容



技术路线



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