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3分钟学会CHIP-seq类实验测序数据可视化 —IGV的使用手册


生信团 上海天昊生物 前天
 
IGV是一款可视化,类似基因组浏览器的工具,
可以在多平台上使用。
本次主要介绍IGV在windows上的使用。


 
 
软件安装
软件下载地址:
下载后正常安装就行(电脑上未安装Jave的可能需要安装一下,360管家下载安装,注意版本要满足要求)。

 
 
软件使用

1. 参考物种选择

 

IGV本身自带Human和Mouse的参考序列,如需要下载其他物种,点击more。

 

2. 导入tdf文件和bed文件

 

导入tdf数据文件

 

导入peak区域文件

 

3. 输入gene名称或染色体位置信息

 

4. 调整峰图高度

 

5. 调整颜色

 

6. 保存图片


 

 

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作者:大熊

审核:有才

来源:天昊生信团

 

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