原创 上海天昊生物
功能介绍提供科研服务及先进高效的检测方法和试剂
绝对定量测序客户代表文章导览
1.塑料污染物降解核心微生物研究
2.脱氧海水与微生物碳氮循环研究
3.微生物与人工湿地污染物清除研究
4.微生物与废水处理功能基因关联研究
5.活性污泥与微生物群落研究
6.水体沉积物与微生物群落研究
7.不同施肥方式对土壤微生物的影响
8.施用氮肥对土壤粘细菌的影响
9.蓄水池生物膜与微生物净水研究
10.食品发酵物与微生物研究
11.农业种植方式与土壤微生物研究
12.农业复垦与土壤微生物研究
中文题目：一种能够降解聚乙烯对苯二甲酸酯和聚乙烯的海洋细菌群落发表期刊：Journal of Hazardous Materials研究目的：筛选具有显著降解PET和PE塑料垃圾的菌群检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V4-V5区）在本研究中，作者对数百个与塑料废弃物相关的样品进行了筛选，发现了一个能够高效定殖和降解PET和PE的海洋细菌群落。利用天昊Accu16S®细菌绝对定量测序专利技术，通过对菌群组成种类和丰度进行定量分析，发现有5类细菌为优势种群。结合培养技术成功，最终成功获得一个能稳定共存并具有显著降解PET和PE塑料垃圾的菌群。本研究发现了一个可有效降解PET和PE的海洋细菌群落，为塑料降解途径及其相关的生物和机械过程提供了新的见解，为开发针对塑料废物的微生物产品奠定了坚实基础。
摘自原文图5：细菌群落的三种核心细菌的丰度量化和塑性降解结果。
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祝贺！天昊Accu16S细菌绝对定量测序项目登陆顶级环境杂志《Journal of Hazardous Materials》；
中文题目：渤海脱氧海水中微生物碳氮循环的转录组学证据发表期刊：Environment International研究目的：探讨脱氧海水中的微生物群落结构和转录活性模式检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V4区）本研究选择渤海两个观测点表层、中层和底层三个深度不同溶解氧的样品进行比较分析。通过滤膜过滤海水，收集微生物，用于Accu16S®细菌绝对定量测序和宏转录组分析。本研究分析了缺氧渤海优势细菌和古菌的群落组成和转录活性变化，揭示脱氧环境中微生物介导的碳和氮循环。结果表明，奇古菌尤其是氨氧化的沿海生态型，对低氧水生环境有很强的适应能力，并进行化能自养固碳，对脱氧环境下的碳流动具有很大贡献。
摘自原文图2：A31和A45地点自由生活(0.2-3.0mm)和颗粒相关(3.0-20mm)两种大小状态原核生物群落的微生物组成柱状图。>>查看全文解读
祝贺！天昊Accu16S细菌绝对定量助力脱氧海水微生物碳氮循环研究登陆一区《Environment International》；
中文题目：中试规模两级潮汐流人工湿地中多孔基质和功能菌属的协同作用对低温下营养物质的高效去除发表期刊：Bioresource Technology研究目的：探究微生物在人工湿地的污染物清除中的作用检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）本研究以页岩陶粒（SC）和活性氧化铝（AA）为填料，建设中试规模两级潮汐流人工湿地TFCW（SC-AA-TFCW），用于低温（<15℃）营养物质的去除。在17种反硝化细菌中，好氧反硝化细菌（ADNB）的绝对丰度最高，其次是兼性厌氧反硝化细菌（FADNB）和自养反硝化细菌（AUDNB）。一些ADNB与营养物质去除相关的关键功能基因之间存在正交作用。溶解氧和还原元素是改变ADNB组成的主要环境因素。SC-AA-TFCW在低温下具有高效的污染物去除性能。与FADNB和AUDNB相比，ADNB的绝对丰度最高。NH4+-N同化是启动阶段NH4+-N去除的主要途径。在稳定期，异化和同化NO3--N还原和完全反硝化是TN转化的主要原因。ADNB与关键功能基因之间主要存在正交作用。总的来说，本研究阐明了多孔基质和ADNB在去除营养方面的协同作用。
摘自原文图3：SS-AA-TFCW中8个生物膜样品的主要属的绝对定量：（a）主要细菌属的热图；（b）潜在反硝化菌的总丰度。图（a）中的1、2、3分别代表好氧反硝化细菌（ADNB）、兼性厌氧反硝化细菌（FADNB）和自养反硝化细菌（AUDNB）。>>查看全文解读
喜讯！天昊16S扩增子绝对定量测序项目文章登陆《Bioresource Technology》；
中文题目：潮汐流人工湿地异养硝化-好氧反硝化、氮代谢基因和关键细菌之间的数量生态学关联发表期刊：Bioresource Technology研究目的：在中试规模的两级潮汐流人工湿地(TFCW)中探索异养硝化-好氧反硝化的定量机制。检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）研究者通过对中试规模的两级潮汐流人工湿地相关检测，探索了潮汐流人工湿地异养硝化-好氧反硝化、氮代谢基因和关键细菌之间的数量生态学关联，并在此基础上，提出了异养硝化和好氧反硝化细菌的氮转化机理和分散式污水处理的工程意义。实验采用填充页岩陶粒(SC)和活性氧化铝(AA)，分别构建了两阶段中试规模的TFCW。利用Accu16S®细菌绝对定量测序技术，发现优势菌属为以Ferribacterium铁杆菌属为核心的异养硝化和好氧反硝化（HN-AD）细菌，通过硝酸盐同化和完全反硝化(NO3--N→N2)同时去除NH4+-N和NO3--N。本研究结果表明，Accu16S®扩增子绝对定量测序方法可通过确定HN-AD细菌丰度和氮代谢基因拷贝数，更精确的用于定量的评估，深入阐明HN-AD、氮代谢基因和关键细菌之间的数量关联，为应用TFCW运行提供了理论基础。
摘自原文图2：SC-AA-TFCW中细菌群落结构(a)、多样性(b)、优势菌门相对丰度(c)和优势菌门绝对丰度(d)。
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又一篇！天昊Accu16S细菌绝对定量测序项目文章登陆国际顶级环境工程杂志《Bioresource Technology》；
中文题目：低温下活性污泥硝化系统中基于全尺度分类的微生物群落和抗生素抗性基因对阿奇霉素和铜复合污染的响应发表期刊：Bioresource Technology研究目的：探讨抗生素和重金属复合污染对污水处理厂处理性能和ARGs丰度增加的生态效应影响检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）本研究分析了低温下活性污泥硝化系统中优势/稀有菌属和ARGs对阿奇霉素(AZM) 和铜复合污染的短期响应。实验检测了复合污染对硝化作用的抑制。四种AZM剂量浓度以及没有AZM和铜的对照样本，发现在低温条件下，随着AZM浓度的增加，复合污染对硝化的抑制作用更加明显。利用天昊生物Accu16S®细菌绝对定量测序，分析了15个混合活性污泥样本中的细菌多样性和群落结构的变化。AZM和铜的复合污染影响了胁迫和效应后时期的细菌多样性和丰富度，.稀有或优势分类菌群(CRAT)是重要的类群。氨氧化古菌在氨氧化作用中扮演重要角色，氨氮同化为有机氮和反硝化作用可能是去除氮的重要途径。ARGs亚型之间存在更多的共生模式，高浓度的AZM可能会促进ARGs的增殖。除了一些优势菌群外，稀有菌群、潜在病原体和脱氮功能菌属都是ARGs的主要潜在宿主。
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祝贺！天昊客户微生物扩增子项目成功登陆环境工程和食品科学一区杂志；
中文题目：沉积物减缓抗生素对反硝化作用的抑制作用：功能基因、微生物群落和抗生素抗性基因分析
发表期刊：Science of the Total Environment研究目的：沉积物如何影响抗生素对反硝化和反硝化细菌群落检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）本研究沉积物样品在长江监测点采集，选择了磺胺甲恶唑（SMX）、四环素（TC）和氧氟沙星（OFL）3种抗生素作为目标有机污染物。在没有和有沉积物情况下，研究了抗生素对水体中NO3--N反硝化作用的影响。通过Accu16S®细菌绝对定量测序和qPCR分析了反硝化微生物群落结构和功能基因，本研究揭示抗生素和沉积物对反硝化作用的影响机制，强调了抗生素对反硝化作用的影响不容忽视。本研究还表明沉积物在减缓抗生素对反硝化作用的影响中的关键作用。这些结果为评估天然水中抗生素的潜在风险提供了新的见解。
摘自原文图4：不同暴露组中门(a)和属(b)水平的微生物群落组成；(c)PICRUSt2预测的微生物群落代谢途径。>>查看全文解读
Sci Total Environ. | 天昊专利技术Accu16S细菌绝对定量测序在水体沉积物抗生素污染研究中的新进展；
中文题目：高通量微生物绝对定量测序揭示不同施肥应用对种植番茄的滨海盐渍土壤细菌群落的影响发表期刊：Science of the Total Environment研究目的：探讨不同施肥方式对番茄盐渍土壤细菌群落组成的影响检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V4-V5区）本研究采用Accu16S®细菌绝对定量测序方法，分析了4种不同施肥方式（100%生物有机肥、70%生物有机肥和30%化肥、30%生物有机肥和70%化肥、100%化学肥）对番茄盐渍土壤细菌群落组成的影响。田间试验结果表明，70%生物有机肥加30%化肥是沿海滩涂地区发展番茄栽培（提高产量和果实品质）的最佳剂量。盆栽试验对番茄的生长也有类似的结果，同时表明70%生物有机肥加30%化学肥料对土壤微生物群的活化效果最好。RDA和皮尔逊相关分析表明，土壤养分，特别是有效磷、有效钾和土壤盐分是影响该生态系统细菌群落的主要环境因子，但有机质含量和土壤酸碱度也在微生物群落的组装中起着重要作用。肥料对盐渍土养分的输入显著增加了细菌的总丰度，但同时也降低了细菌群落的多样性，而不考虑负载肥料的形式。土壤细菌群落组成的变化主要受土壤盐度和养分有效性（包括P和K）的影响。在四种施肥方式中，70%生物有机肥与30%化肥的组合是发展农业种植的最佳途径，如获得较高的番茄生长、产量和田间果实品质，以及沿海盐渍土壤的活性微生物群。此外，利用spike-in内标的高通量绝对定量测序技术是一种非常有前途的方法，可以使人们对细菌生态学有一个全面而深入的了解。
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祝贺！天昊生物16S扩增子绝对定量测序技术助力客户登陆Science of the Total Environment；
中文题目：长期施氮降低了捕食性粘细菌的相对丰度和绝对拷贝数，改变了土壤中粘细菌群落结构发表期刊：Science of the Total Environment检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V4-V5区）本研究设计了12种常用施肥处理：1）不施肥对照（control, CK）；2）氮化肥（N）；3）氮磷化肥 （NP）；4）氮钾化肥（NK）；5）磷钾化肥（PK）；6）氮磷钾化肥(NPK)；7）氮磷钾化肥配施猪粪(NPKM)；8）1.5倍用量的氮磷钾化肥配施猪粪（1.5NPKM）；9）氮磷钾化肥配施秸秆；10）氮磷钾化肥配施猪粪+大豆轮作（NPKMR）；11）猪粪（M）；12）休耕（Nature）。每种处理共采集四个重复，随机选择三个样本进行Accu16S®细菌绝对定量测序。结果表明，施氮（N簇）和施猪粪（M簇）的粘细菌群落结构存在显著差异。施加氮肥显著降低了粘细菌的相对丰度、拷贝数、物种积累指数和Shannon指数。施氮肥引起的土壤酸化是导致土壤粘细菌相对丰度和绝对拷贝数下降的最主要原因；粘细菌相对丰度和绝对拷贝数的变化与细菌的α和β多样性指数的变化显著相关，粘细菌群落的变化可能是影响整体微生物群落变化的重要因素。
摘自原文图2：粘细菌群落对CK、M、N簇土壤的响应。>>查看全文解读
喜讯！天昊生物16S扩增子绝对定量测序项目文章再次登陆《Science of the Total Environment》；
中文题目：作为雨水清洁生产预处理单元的蓄水池：生物膜细菌群落和功能菌属在水质改善中的作用发表期刊：Journal of Environmental Management研究目的：系统探讨雨水储罐中生物膜的净水功能和机理。检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）反应器R1和R2分别模拟新旧雨水储罐。比较了新旧雨水储罐的生物净水性能差异。本实验在40、70和100天从R1和R2收集生物膜样品，利用天昊Accu16S®细菌绝对定量测序进行微生物多样性检测。采用全尺度分类方法对雨水蓄水池中生物膜细菌群落组成进行综合分析，通过主成分分析（PCA）分析不同细菌类群之间群落结构的相似性。生物膜的存在增强了雨水蓄水池的自净功能。适当缩短水力停留时间（HRT）有利于提高污染物去除性能和水质生物安全。AT和CRAT在五个细菌类群中占主导地位。功能性细菌随着时间的推移而富集并形成复杂的相互作用。氨同化、完全反硝化和异化/同化硝酸盐还原可能是主要的氮代谢途径。HRT对群落变异有很好的解释，而长时间的HRT不利于功能性细菌的生长。以蓄水池为预处理单元，充分利用其生物净水功能，可以减轻后续处理单元的负荷，有利于雨水清洁生产的可持续性。
摘自原文图3：R1和R2中的生物膜细菌群落：（a）PCA分析；(b)细菌分类群的绝对丰度变化。>>查看全文解读
J Environ Manage. | 天昊专利技术Accu16S细菌绝对定量测序在生物膜净水研究领域取得新进展；
中文题目：不同类型大曲中的细菌、真菌和噬菌体群落及挥发性物质研究发表期刊：Food Research International研究目的：系统评估大曲中细菌和真菌的绝对丰度以及噬菌体在食物发酵系统中的作用检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）和AccuITSTM真菌绝对定量测序（ITS2区）从中国不同酒厂收集三类大曲样品：使用大麦和豌豆制备的LTDQ（40–50℃）样品，使用小麦制备的MTDQ（50–60℃）样品，和使用小麦制备的HTDQ（60–70°C）样品。从储藏室的顶部、中部和底部收集3个平行样品，然后合并形成1个样品。将每个混合样品分成两部分；一部分在-20℃下保存，用于理化和代谢物分析，包括水分、pH、酸度、液化力、糖化力、酸性蛋白酶活性、糖、多元醇、酸和氨基酸的组成和含量，以及挥发性化合物的检测分析。另一部分在-80℃保存用于Accu16S®细菌（V3-V4区）和AccuITSTM真菌（ITS2区）绝对定量测序分析和宏病毒组分析。在这本研究使用天昊生物人工合成的spike-in序列的微生物绝对定量测序专利技术，综合比较不同类型大曲中微生物群落的相对和绝对丰度。检测三种大曲的挥发性成分也发现存在显著差异。大曲中共检测出105种挥发性化合物，其中14种被鉴定为区分三种大曲的重要化合物。相关性分析表明，这些代表性化合物的形成与Saccharopolyspora、Thermoactinomyces、Kroppenstedtia、Byssochlamys和Thermomyces密切相关。此外，本研究首次利用宏病毒组学观察了三种大曲中病毒的组成和功能。本研究强调了使用绝对定量以避免在比较微生物组分析中对差异分类群的误判，并为大曲中的噬菌体群落和功能提供了新的见解。
摘自原文图1：三种大曲样本中相对和绝对定量检测的细菌优势菌属(A)。LEfSe分析显示了共有的显著差异细菌分类群(B)。>>查看全文解读
一区新文 | 天昊专利技术Accu16S细菌和AccuITS真菌绝对定量测序助力大曲发酵研究登陆《FRI》；
中文题目：荔枝园间作平托花生有效提高了土壤速效钾含量，优化了土壤细菌群落结构，提高了细菌群落多样性发表期刊：Frontiers in Microbiology研究目的：探讨间作种植方式对土壤性质、酶活性以及土壤细菌群落结构和多样性的影响检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）该研究对荔枝与平托花生间作（LP）和荔枝单作（CK）种植区进行土壤样本采集，一部分用于Accu16S®细菌绝对定量测序分析（V3-V4区），一部分风干用于测定土壤化学性质和土壤酶活性。土壤性质分析包括：土壤总有机碳（SOC），总氮（TN）、总磷（TP）、总钾（TK）和有效氮（AN）、有效磷（AP）、有效钾（AK）、硝态氮（NO3--N）、铵态氮（NH4+-N)、水分含量、pH。土壤酶活性的测定包括：土壤蔗糖酶（s-SC）活性、土壤脲酶（s-UE）、土壤过氧化氢酶（s-CAT）、土壤多酚氧化酶（s-PPO）和土壤蛋白酶（s-PT)。本研究结果证明了荔枝单作模式和荔枝园间作4年以上的平托花生在土壤性质、土壤酶和土壤细菌群落方面的差异。间作土壤的土壤AK含量显著高于荔枝单作，土壤微生物结构显著优化，因为AK是影响细菌群落多样性的主要环境因素。LP中SC、酸性PT和UE的活性高于CK。间作土壤细菌的丰富度和多样性高于CK，土壤细菌群落结构明显优化为间作模式，有利于荔枝栽培的优越土壤环境条件。通过对土壤微生物群的功能预测分析，推测对土传病害的抗性与间作模式下的土壤细菌群落结构高度相关。
摘自原文图3：在门水平(A)和属水平(B)的所有与环境变量相关的样品中与主要土壤细菌群落的冗余分析(RDA)。>>查看全文解读
Front Microbiol. | 天昊专利技术Accu16S细菌绝对定量测序在荔枝园种植领域取得新进展；
发表期刊：Applied Soil Ecology研究目的：探讨施肥和种植等农业复垦做法对沙漠土壤微生物组的多样性、组成和功能的影响检测方法：Accu16S®细菌绝对定量测序（V3-V4区）取样策略：3个分组x3个葡萄园x3个重复，共27个研究区域位于腾格里沙漠东南边缘葡萄园，原风积沙土用羊粪及过磷酸钙和磷酸铵进行施肥后种植葡萄。本实验采集三个葡萄园的植物附近（PLT），施肥沟（FTL）和同一地区的开阔地对照（CON）三类土壤，用来进行Accu16S®细菌绝对定量测序分析和土壤理化性质测定。本研究结果表明，将沙漠土地开垦为农业用途，显着增加了土壤细菌的总丰度，同时降低了它们的多样性。属于Firmicutes、Proteobacteria、Actinobacteria和Acidobacteria门的细菌是施肥的主要响应者，其中，Bacilli和Actinobacteria被发现是群落网络中的关键类群。在沙漠生态系统中，植物对土壤细菌群落的塑造要小于施肥的影响。
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医学、农学新应用，天昊Accu16S细菌绝对定量测序技术在骨质疏松和农业复垦领域收获新文；
天昊生物
Accu16S®细菌与AccuITSTM真菌绝对定量测序
天昊生物一直秉承“自主研发、创新驱动”的发展理念，在微生物多样性检测领域潜心研发多年，率先于2019年和2021年在国内市场成功推出了Accu16S®细菌和AccuITSTM真菌绝对定量测序技术服务，并顺利申请了国家技术专利。我们的微生物绝对定量技术完美的解决了国内同类相对定量扩增子测序服务“只测比例，不知数量”的技术痛点，一个样本单次检测，即可同时获得样本微生物多样性的“相对比例”和“绝对数量”，让样本总菌和特定菌种的绝对数量结果唾手可得。
我们的服务一经推出，便获得了客户和市场的高度认可。截至目前，公司检测项目累计已达数百项，客户发表SCI文章32篇，其中JCR分区在Q1区的文章高达19篇，这些数据充分说明天昊生物绝对定量专利技术已经得到了高水平杂志的普遍认可，在微生物多样性绝对定量检测领域处于国内领先地位。
浅谈：论微生物绝对定量VS相对定量的优越性；
专属含PCR抑制剂的环境样本微生物拷贝数定量的最佳解决方案!；
向“真”而生！天昊生物AccuITS真菌绝对定量测序服务重磅上线；
The ISME Journal：为什么微生物相对定量不能代替绝对定量；
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