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第2期:天昊微生物绝对定量测序“一作昊课堂”讲座预告


原创 上海天昊生物 


为了更好的总结天昊生物在微生物绝对定量测序特色创新技术上所取得的成绩,我们在11月17日顺利举办了“一作昊课堂”第1期讲座活动!在上期活动中,我们荣幸的邀请到上海复旦大学附属眼耳鼻喉科医院的刘会勤老师和北京工业大学市政工程系的檀旭老师,为我们分享了通过绝对定量分析技术横向比较下咽鳞癌患者口咽咽拭子、肿瘤组织及癌旁的菌群结构,以及潮汐式生物滤池的异养硝化脱氧机制与菌落构效关系方面的研究成果。错过收看的老师,可以联系我们天昊客服人员获得视频链接。


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“昊技术,好成果!”

“昊讲堂”第2场精彩继续,期待您的莅临!


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关于天昊微生物绝对定量测序特色创新技术



为了解决传统微生物扩增子测序“只能相对定量”的技术痛点,天昊生物投入大量研发人员,率先于2018年推出了创新型微生物绝对定量测序服务。多年来,天昊生物一直聚焦微生物绝对定量技术创新与发展,不断扩展检测范围,提高检测标准,帮助了客户研究论文的高效发表。绝对定量技术取得了“应用领域范围广,文章发表水平高”的骄人成绩,己经成为国内微生物扩增子绝对定量测序领域的行业领跑者



天昊生物绝对定量技术发展

大事件:



★2018年 国内率先推出细菌扩增子绝对定量测序服务,命名为“Accu16S®细菌绝对定量测序”。

2021年 国内率先推出真菌扩增子绝对定量测序服务,命名为“AccuITSTM真菌绝对定量测序”。


→ 2019年 天昊绝对定量测序技术提交专利申请。

→ 2019年 亮相“中国微生物学会学术年会”及“中国肠道大会”,天昊绝对定量技术引关注。

→ 2019年6月 天昊绝对定量在农学环境领域第一篇文章成功发表在《Science of the Total Environment》(IF=10.753)上。

 2019年9月 天昊绝对定量在医学领域第一篇文章成功发表在《Carbohydrate Polymers》(IF=10.723)上。

 2020年 推出绝对定量测序“GS-Online”分析云平台服务。

→ 2021年 天昊生物绝对定量技术“昊论坛”成功举办,邀请三位高分文章第一作者讲座,分享使用天昊绝对定量技术的经验心得。

→ 2022年4月 天昊绝对定量技术在“肠-骨轴”研究领域成功发表在顶级期刊《Science Advances》(IF= 14.957)上。

→ 2022年6月 同时利用天昊细菌+真菌绝对定量技术的第一篇文章成功发表在食品一区期刊《Food Research International》(IF= 7.425)上。

 2022年 参展“中国生物物理学会肠道菌群分会年会”和“中国微生物学会第十届地质微生物学学术研讨会”,并作绝对定量技术大会报告。

→ 2022年 绝对定量检测项目和合作单位数量取得新突破,合作的单位包括清华大学、北京大学、上海交通大学、复旦大学、中南大学湘雅医院、北京工业大学、潍坊医学院、南京农业大学、厦门大学、中国科学院海洋研究所、中国科学院南京土壤研究所、中国农业大学、南京农业大学、南京财经大学、南京中医药大学、华中科技大学、宁夏大学、东北农业大学、新疆医科大学公共卫生学院、山东大学齐鲁医院、武汉大学中南医院、海南农科院等多个科研单位,覆盖环境微生物和肠道微生物等领域。


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天昊生物绝对定量测序“GS-Online”分析云平台


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天昊绝对定量技术助力客户的“肠-骨轴”研究登陆《Science Advances》



天昊生物绝对定量技术

发表文章情况:



截至目前,天昊客户利用微生物绝对定量技术共发表SCI文章32篇,其中JCR分区在Q1区的高分文章多达19篇,研究领域涉及医学、环境、农学和生态等各个领域,样本类型包括人类及动物粪便、土壤、体外发酵液、水体生物膜、酒类发酵物及口拭子DNA样本等。




 具体涉及研究方向包括: 



 医学领域:
1-骨轴调控股骨头坏死机制重大发现
2:帕金森病与肠道菌群新成果
3:阴道炎治疗与肠道菌群研究
4:头颈癌与肠道菌群研究
5:骨质疏松症与肠道菌群研究
6:肝细胞癌与肠道菌群研究
7:肠道菌群体外发酵研究
8:金针菇多糖抗炎与肠道菌群研究
9:益生元与人体肠道菌群研究

 环境农学领域:
1:塑料污染物降解核心微生物研究
2:脱氧海水与微生物碳氮循环研究
3:微生物与人工湿地污染物清除研究
4:微生物与废水处理功能基因关联研究
5:活性污泥与微生物群落研究
6:水体沉积物与微生物群落研究
7:不同施肥方式对土壤微生物的影响
8:施用氮肥对土壤粘细菌的影响
9:蓄水池生物膜与微生物净水研究
10:食品发酵物与微生物研究
11:农业种植方式与土壤微生物研究
12:农业复垦与土壤微生物研究


天昊生物创新型Accu16S®细菌和AccuITSTM真菌绝对定量测序服务部分客户文章列表:

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详细了解可参见链接:


为什么天昊生物绝对定量能够

取得国际高水平杂志和客户的认可?



一、现阶段常规扩增子相对定量测序技术存在的不足:


1、常规微生物扩增子测序的数据在通过抽平后,只能获得微生物群落组成的相对比例,这种处理造成了样本微生物实际数量信息的丢失。而只考虑相对比例,不考虑绝对数量上的差异,将无法真实反映样本中实际菌群的组成状态,在与表型数据进行关联分析时,可能会推导出错误结论。


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2、目前研究常用qPCR绝对定量和常规扩增子测序的联合策略来获得菌群绝对丰度和微生物群落结构,但是这就需要使用两个实验平台、两份样本及两次实验操作进行检测。而且qPCR绝对定量技术对样品质量的要求较高,尤其对PCR抑制剂敏感,而这又是土壤和肠道粪便等样本无法完全去除的,进而造成了系统性实验误差,导致结果不够准确。


二、天昊生物创新型Accu16S®细菌和AccuITSTM真菌绝对定量测序服务技术原理:


天昊生物绝对定量测序技术,通过向样品DNA中添加一定量人工合成Spike-in内参标准品序列,进行扩增子文库构建及二代高通量测序,再根据内参标准品测序序列数及绝对拷贝数绘制标准曲线,最终计算出样本中OTU/ASV序列对应微生物菌群的绝对拷贝数。


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三、技术优势:


我们的绝对定量测序方法,基于一个高通量测序平台,一个样本和一次检测,便可同时获得微生物扩增子的绝对定量结果、相对定量结果,以及两种定量的对比分析结果,可谓“一次检测,三种报告内容”!可以完全避免qPCR绝对定量所面临的引物优化、额外样本需求及额外检测操作带来的系统误差大、样本管理难、检测通量小和检测效率低等缺点,可以同时获得样本中总菌的绝对定量数据、优势菌种的绝对定量数据,测序结果更加真实,客观还原菌群结构和丰度比例,并且排除样本中的PCR抑制剂干扰,无样本偏差可直接比较结果。


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详细了解绝对定量技术可参见链接:

“砥砺四载,满誉而来”!天昊微生物绝对定量测序“一作昊课堂”讲座开始啦!
天昊生物—微生物绝对定量测序行业领跑者
盘点 | 天昊生物专利技术--Accu16S细菌与AccuITS真菌绝对定量测序客户文章汇总(医学篇)
盘点 | 天昊生物专利技术--Accu16S细菌和AccuITS菌绝对定量测序客户文章汇总(环境农学篇)








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