3分钟学会微生物多样性云平台数据分析

天昊生物微生物云平台GS-Online是由上海天昊生物构建，主要用于数据测试分析、修改样品名及分组信息的重分析、剔除OTU的分析。

文章导读

一、数据准备

1. 将文件拷贝至新文件夹下

2. 文件选择

必须文件

可选文件

3. 确认文件是否是文本文件

二、数据修改

1. 修改分组名（最常见）

2. 改样品名（比较少见）

三、数据提交

1. 登录

2. 新建项目

3. 新建分析，并从本地上传数据

四、查看运行与数据下载

1. 查看进展

2. 数据下载

3. 结果查看

一

数据准备

数据分析完成后，我们会将分析结果以邮件的形式发送给客户。解压后如上图所示。云平台分析所需的文件均在其中。

1. 将文件拷贝至新文件夹下

subsample_otu.tax.0.03.xls、subsample_otu.repseq.fasta.tre 来自OTU目录下；
cog_for_stamp.txt、kegg_for_stamp.txt 分别来自PICRUSt 目录下的level_2和level_3目录下。cog仅有level2水平，kegg有level3水平。

2. 文件选择
必须文件
subsample_otu.tax.0.03.xls、subsample_otu.repseq.fasta.tre、sample_groups.xls 文件为必须文件，仅提交这3个文件，会运行AlphaDiversity、BetaDiversity和Community分析
可选文件
env.xls文件添加，则新增EnvironmentFactors 分析
cog_for_stamp.txt和kegg_for_stamp.txt文件添加，则新增PICRUSt分析。

3. 确认文件是否是文本文件
使用记事本方式打开，确认有没有乱码。有乱码则不是文本文件（通常是excel文件），需要重新存为文本文件。

二

数据修改

1. 修改分组名（最常见）

打开sample_groups.xls，A列为样品名，B列为组名。直接修改B列组名后保存并关闭，用记事本方式打开看是否乱码。或者修改后复制到新建的记事本文档中，将该新建的文档作为上传的分组文件。

2. 修改样品名（比较少见）
除subsample_otu.repseq.fasta.tre文件外，其他文件均需要修改。修改后的文件仍需要是文本文件。

三

数据提交

1. 登录
http://cloud.geneskybiotech.com/login.html ，账号密码获取，可联系qq管理员（文末扫二维码入群）。