Nature Genetics：复杂疾病或由低频遗传变异决定
近日，美国加州大学伯克利分校、华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位合作的 “对200个人类外显子的测序揭示大量低频率非同义突变的存在”的 研究成果发表在新一期《自然-遗传学》上。
Nature Genetics doi:10.1038/ng.680
Resequencing of 200 human exomes identifies an excess of low-frequency non-synonymous coding variants
研究概况：
该项研究对200个丹麦个体蛋白质编码基因的外显子组进行了深度测序，发现了大量以往未知的单核苷酸多态性位点（SNP），其中大部分在人群中都以较低频率出现。该研究完成了目前在人类外显子区域规模最大、分辨率最精细的遗传图谱，并以翔实的数据证明，人群当中的低频率多态性位点富集了大量能引起蛋白质氨基酸序列改变的变异，而这类变异在人群中受到自然选择作用，可能具有影响人类健康的功能。
专家点评：
以往对多基因控制的复杂疾病所进行的关联分析研究尽管从理论上可行，并在实践中发现了许多疾病关联基因，但却仅能解释复杂疾病遗传性的一小部分， 这一现象被称为“遗传度缺失”，是当前复杂疾病基因组研究的一个主要难题。该研究首次证实影响人类健康和疾病易感性的多态性位点在人群中往往频率低，但是相关位点的个数很多。 既往的复杂疾病关联分析使用的基因分型芯片仅对常见多态性位点进行测定，而无法研究低频率多态性位点，从而漏掉大量疾病关联位点造成“遗传度缺失”。该研究不仅指出了目前主流疾病研究方法的缺陷 ，并颠覆性地提出疾病关联分析应充分使用测序技术而非基因分型技术，从而对改变科学家对复杂疾病的研究手段， 推动人类健康与医学研究的进步具有里程碑意义。该研究提示的CDRV理论倾向，对低频CNV的研究以及全基因组测序进行低频突变检测的研究方向都给给予强力的支持。
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